Όταν συλλέγεται κλινικά φρέσκο αίμα, προστίθεται αποστειρωμένο κιτρικό νάτριο για να αποφευχθεί η πήξη του αίματος, οπότε το κιτρικό νάτριο είναι γνωστό ως αντιπηκτικό.
Στη βιομηχανία τροφίμων και ποτών, χρησιμοποιείται ως αρωματικός παράγοντας και σταθεροποιητής.
Στη φαρμακευτική βιομηχανία, χρησιμοποιείται ως αντιπηκτικό, εκπνευστήρα και διουρητικό.
Στην βιομηχανία απορρυπαντικών, μπορεί να αντικαταστήσει το τριπολυφωσφορικό νάτριο ως πρόσθετο για μη τοξικά απορρυπαντικά.
Χρησιμοποιείται επίσης στη ζύμωση, στα ενέσιμα διαλύματα, στα φωτογραφικά χημικά, στην ηλεκτροπληγή κλπ.
Είναι ένα από τα βασικά αντιδραστήρια για βιολογικά πειράματα.